药物治疗应以肾损害的程度，采取分期治疗方法。

Ⅰ期(亚临床损害型)：此期特点是病人无蛋白尿、高血压和氮质血症，但肾血浆流量减少，肾活检可见典型组织学改变，血管反应性异常，血浆肾素活性可增高。治疗主要是预防和避免各种使肾血流量进一步减少的因素如心衰、出血、脱水、温度突降等，可适当应用血管扩张药物，但其有益作用还待证实。

Ⅱ期(临床肾损害型)：特点是病人有明显高血压、蛋白尿和氮质血症，部分病人血浆肾素活性升高，病人肾功能可保持稳定，或缓慢发展到肾功能衰竭。治疗包括控制血压和维持肾血浆流量。高血压伴血浆肾素活性增高者，可选用转换酶抑制剂如卡托普利，从每日12  .5mg开始，逐渐增大剂量，最大每日可用至150mg。此外可适当应用利尿剂和钙离子拮抗剂。高血压伴血浆肾素活性正常者，应联合应用血管扩张剂和利尿剂，必要时可加用β-受体阻滞剂或甲基多巴等，但β-受体阻滞剂可加重雷诺现象，应予注意。此期若存在下列情况易发生肾危象综合征：①疾病早期皮肤进行性增厚；②贫血；③心包积液或充血性心衰。有人主张，对这些病人，即使无高血压，也可给予血管扩张剂或转换酶抑制剂进行预防，但尚无文献支持该做法。

Ⅲ期(肾危象综合征)：此期是指起病3～4年内出现下述情况：①  血压突然急骤升高；②血浆肾素活性在正常2倍以上；③肾功能迅速恶化；④眼底棉絮状渗出或出血。肾危象综合征是威胁病人生命的严重并发症，常在数天或数周内出现心力衰竭、高血压脑病、终末期肾衰，因此，必须积极处理。治疗关键是控制血压，可联合应用转换酶抑制剂、强效血管扩张剂、利尿剂等。通常血压控制后，肾功能可改善或稳定，眼底病变好转。有些病人即使血压已被控制，但肾功能仍进行性恶化，最终需透析治疗或肾移植。如药物无法控制高血压，病情加重，则需行双肾切除术来降压。

Ⅳ期(终末肾衰期)：治疗主要靠血透和肾移植。一般认为硬皮病小血管病变较多，腹膜透析效果可能不良。

抗凝与抗血栓药物作用尚不清，有人认为可以试用；激素对皮肤和内脏病变的作用有限，对肾损害无效，但亦有学者主张可试用皮质激素和细胞毒药物治疗6～12个月。