甲状舌管囊肿多见于1~10岁的儿童，也可见于成年人。囊肿可发生于自舌盲孔至胸骨切迹之间颈正中线的任何部位，以舌骨上下部最常见。囊肿生长缓慢，呈圆形，多为胡桃大小，位于颈中部位，有时微偏一侧。肿块质软，周界清楚，与周围组织无粘连，病员多无自觉症状。位于舌骨以下的囊肿，在舌骨体与囊肿之间可扪及坚韧的索条与舌骨体相连，此时肿块可随吞咽及伸舌等动作而移动。囊肿发生于舌盲孔下面或前后部时，舌根部可因肿胀而发生吞咽、语言及呼吸功能障碍。囊肿可以通过舌盲孔与口腔相通而继发感染。囊肿感染自行破溃，或误诊为脓肿而切开后，可形成甲状舌管瘘。有时也可见到先天的原发瘘。甲状舌管瘘如长期不治，可以发生癌变。穿刺甲状舌管囊肿可抽出透明、微混浊的黄色稀薄或粘稠液体。