附睾结核被中医归于子痰范畴。中医认为其属阴证、虚证， 治疗主张以培补为主，化痰软坚为辅，以求正气恢复，痰核渐消。据其病程演变，分为初起、成脓、溃后三个阶段。初起阶段主张以补肾为主，化痰散结，温经通络为辅，用阳和汤加荔枝核、橘核等，兼服小金片；成脓期，治以滋阴清热，除湿化痰，佐以透脓解毒，用滋阴除湿汤合透脓散加减；到溃后阶段，阴虚者，继服滋阴除湿汤。证见阳虚者，需补肾温阳，常服先天大造丸或右归丸。配合外治，未化脓者，用冲和膏外敷，或经常用葱归溻肿汤坐浴。脓肿形成不能吸收者，应切开排脓，溃后成漏，可用千金散药线以去腐生肌，亦可手术将坏死组织刮除。

西医对附睾结核的治疗，主要有抗痨药物及手术两种途径。 使用抗痨药物宜联合应用，药物及剂量如下：

链毒素：每日肌注1克，连用2周，以后每周2次，每次1克。

异烟肼：每次0.1克，每日3次口服。

对氨基水杨酸钠：每日8～12克，分3次口服。

上述药物应用足量而不间断，一般连续应用3～6个月， 然后根据症状与体征，以及精液及前列腺液化验来估计治疗效果。倘若上述药物疗效不佳时，可考虑应用氨硫脲，环丝氨酸，乙硫异烟胺，吡嗪酰胺，卡那霉素等药物治疗。在药物治疗同时，应该注意休息，同时加强营养，补充维生素。

当附睾结核结节较大，直径超过0.5～1厘米，而且病变范围广泛，甚至产生结核性脓疡或累及阴囊壁成为窦道时，经抗痨治疗效果不佳时，说明附睾结核已病入膏肓，附睾功能已丧失，留着不但多余，反倒可能对身体健康不利，所以干脆手术切除掉。若睾丸未遭波及，则必须保留睾丸。

勿须质疑，双侧附睾切除，生育力随即丧失。虽然有的医生尝试采用输精管睾丸吻合术，但因手术的成功率很低，故手术后生育力的恢复机会也微乎其微。